清洁、高效、可持续，拥有上述特征的氢能被视作未来脱碳世界的重要能源载体。纯氢在自然中并不独立存在，为了区分不同生产来源的清洁程度，人们按照碳强度由高到底标注出灰氢、蓝氢和绿氢。主流观点是，在终极目标绿氢（太阳能、风能制取的氢能）实现之前，利用化石能源制造但配以碳捕获技术的“蓝氢”是产业发展必经的过渡阶段。
不过，8月12日，康奈尔大学和斯坦福大学的研究人员在《能源科学与工程》发表的一项新研究显示，颇受追捧的蓝氢并没有想象中清洁：蓝氢全生命周期温室气体排放强度比燃烧天然气取暖还要高20%。该论文是首篇经设有同行评议的期刊发布、关于蓝氢温室气体排放的研究。
作者们在论文中称，目前大多数氢气都是通过蒸汽甲烷重整（SMR）产生（也即灰氢），这种制氢方式碳排放高。越来越多人建议利用碳捕获和封存技术（CCS）减少灰氢的碳排放，蓝氢也因此在宣传中被打上了“低排放”的标签，被看作未来可以替代化石燃料的重要清洁能源。
研究发现，蓝氢的主要温室气体包括二氧化碳和未燃烧的甲烷。即使假设捕获的二氧化碳可以永久储存，因存在大量逃逸性甲烷释放，蓝氢制取的温室气体排放量仍然很高。
该研究称，假设天然气甲烷逃逸率为3.5%，可在大气中留存约20年，则蓝氢的总二氧化碳排放当量比灰氢少9%-12%。但由于碳捕获和封存需要使用天然气作为动力能源，蓝氢的逃逸性甲烷排放量高于灰氢；且蓝氢全生命周期温室气体排放比燃烧天然气或煤炭取暖的排放还高约20%。即使将天然气甲烷逃逸率降低到1.54%，蓝氢的温室气体排放仍高于单纯燃烧天然气，仅比灰氢少18%-25%。

从左至右分别为：灰氢、蓝氢（捕获SMR产生的二氧化碳但不捕获燃烧天然气运行SMR设备时产生废气中的二氧化碳）、蓝氢（同时捕获SMR过程和废气中的二氧化碳）、燃烧供热的天然气、燃烧供热的柴油和燃烧供热的煤

据彭博新能源（BloombergNEF）估计，到2030年，全球各地绿氢制取成本可能都将低于蓝氢。而蓝氢所依赖的CCS技术，多年来推广困难、成本居高不下。
国际能源署数据显示，相关投资仅占全球清洁技术投资的不到0.5%，全球目前有21个CCUS（碳捕捉、利用和封存）项目，每年二氧化碳捕获能力为4000万吨。